En muchos países, los estudios de evaluación sobre la seguridad alimentaria han comparado los nuevos piensos para el ganado con sus homólogos convencionales. Estas comparaciones tienen en cuenta, por ejemplo, la composición nutricional de los piensos y sus efectos sobre animales así como sobre seres humanos que ingieren los productos animales derivados.

Los estudios también han considerado el destino del ADN modificado en el tracto digestivo del animal. Los resultados indican que tanto el ADN como las proteínas modificados descomponen rápidamente en el sistema digestivo, y no se han observado efectos nocivos ni sobre el crecimiento, ni sobre el peso corporal, ni sobre la conversión del pienso, ni sobre la composición de nutrientes, ni sobre la producción de leche. Un examen de la FAO llegó a la conclusión que es muy improbable que los genes puedan transferirse de plantas modificadas genéticamente a bacterias que causen enfermedades. Sin embargo, recomendó que no se usaran en plantas modificadas genéticamente los genes que determinan la resistencia a antibióticos que son críticos para tratas enfermedades infecciosas humanas.

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